在2010年，蕭亞軒和周湯豪也有傳過一些緋聞，但蕭亞軒對其持否認態度。
最令網友們感到不可思議的就是蕭亞軒與柯震東的戀情，在2012年的4月份，二人被拍到在月份，二人被拍到在臺灣矮樹牽手漫步，由此二人戀情曝光，當時柯震東因為拍攝了《那些年，我們一起追過的女孩》，一時名聲大噪。可是沒想到我們的柯景騰沒有和校花沈佳宜在一起，而是喜歡上比他大12歲的蕭亞軒，網友們簡直不能接受，一時間心痛不已，在當時也是引起了網友們的熱議。
2013年5月29日，柯震東被拍到在玩具店買海賊王公仔，不是送給蕭亞軒而是送給內地的一個紅三代，因而被懷疑移情別戀，但是蕭亞軒對外宣稱二人關系很好，十分穩定，4月底，二人就被傳分手，直至6月12日，柯震東的經紀人表示柯震東目前是“單身”狀態。
石正祥不僅是一個新加坡身價百億富家公子，也是吳建豪的小舅子，英文名叫Elroy，和蕭亞軒相識于吳建豪婚禮上。兩人被曝光于2015年7月份吵架，之后男方不再關注她，隨后她承認兩人關系已回歸到好朋友的關系。
陳樺是蕭亞軒在2017年上半年的男友，他是臺裔美籍人，還在世界大學高爾夫錦標賽上代表臺灣取得銅牌的好成績。在2017年3月份，還被拍到二人甜蜜恩愛的畫面。
在2017年下半年，10月份的時候，臺媒拍到了蕭亞軒的新男友，不到幾個月，蕭亞軒又換新男友了。這次的男友有著一張吸引眾多小妹妹的國民初戀臉，看起來還是一個學生，穿著白T恤，毫無疑問可以成為校草了。但是他不喜歡20歲的小姐姐啊，而是喜歡比他大的，39歲的阿姨。因為基本找的男朋友都是小鮮肉吧。蕭亞軒據傳言是少男殺手，她每一段戀情都是姐弟戀，女生說想體驗一下蕭亞軒的快樂，應該是想來一段姐弟戀吧，如果你比女生年紀小，那女生說的就是你。
她最吸引人的是她的每段戀情。其實從幾年前，關于蕭亞軒“變臉”的傳聞就從未停息過，從一開始的單眼皮到后來的“魅惑電眼”，甚至有媒體還形容她是“徹底變臉”、“百變女王”，此次現身雖然沒有之前那么嚴重，但從視頻中也能看出面部確實有一些僵硬，下巴輪廓略顯怪異。
